Terdapat beberapa kaedah dalam prosedur diagnostik pembezaan serta beberapa varian antaranya. Tambahan pula, prosedur diagnostik pembezaan boleh digunakan secara serentak atau berselang-seli dengan protokol, garis panduan atau prosedur diagnostik lain.

Contohnya, dalam kes kecemasan perubatan, mungkin tidak ada masa yang mencukupi untuk melakukan apa-apa pengiraan terperinci atau anggaran kebarangkalian yang berbeza, dalam hal ini, protokol ABC (Airway, Breathing and Circulation; "saluran udara, pernafasan dan peredaran") mungkin lebih sesuai. Kemudian, apabila keadaan menjadi kurang akut, prosedur diagnostik pembezaan yang lebih komprehensif boleh diguna pakai.

Prosedur diagnostik pembezaan boleh dipermudahkan jika tanda atau simptom "patognomonik" ditemui (dalam kes ini, hampir pasti bahawa keadaan sasaran wujud) atau jika tiada tanda atau gejala , (dalam hal ini ia adalah hampir pasti bahawa keadaan sasaran tidak ada).

Seorang pakar diagnostik boleh menjadi selektif, mempertimbangkan pertama gangguan yang lebih berkemungkinan (pendekatan kebarangkalian), lebih serius jika tidak didiagnosis dan tidak dirawat (pendekatan prognostik), atau lebih responsif terhadap rawatan jika ditawarkan (pendekatan pragmatik).[5] Oleh kerana kebarangkalian subjektif kehadiran sesuatu keadaan tidak pernah tepat 100% atau 0%, prosedur diagnostik pembezaan mungkin bertujuan untuk menentukan pelbagai kebarangkalian ini untuk membentuk petunjuk bagi tindakan selanjutnya.